مقدمه: ترخینه یک غذای نیمه آماده و از محصولات تخمیری سنتی غرب ایران (کرمانشاه، ایلام، کردستان و لرستان) است. ترخینه­ی تر دارای اثرات ضد میکروبی نیز می­باشد و در مناطق کردنشین به عنوان داروی سنتی برای درمان بیماری­هایی با علایم عفونت­های مجاری فوقانی دستگاه تنفسی به کار می‌رود. هدف از این پژوهش شناسایی فلور میکروبی ترخینه‌ی سنتی و صنعتی جهت تعیین قابلیت این غذا به عنوان یک فراورده­ی سنتی سلامتی­زا با پتانسیل پروبیوتیکی می­باشد.مواد و روش: در این پژوهش، نمونه‌های ترخینه خشک، ترخینه تر و ترخینه صنعتی با توجه به روش‌های استاندارد از نظر کل جمعیت میکروبی، pH و میزان رطوبت بررسی شدند و سپس انواع گونه‌های لاکتیک اسید باکتری‌ها براساس خصوصیات بیوشیمیایی و مورفولوژیکی مورد جداسازی و شناسایی قرار گرفت.یافته‌ها: نتایج این پژوهش نشان داد که نمونه ترخینه تر دارای بیشترین مقدار لاکتیک اسید باکتری بود که شامل (67%)L.nagelii، (3/21%)L.bifermentans، (6%)Leu.cermoris، (45/1%)L.fructosus، (1%)L.fermentum، (9/0%)L.intestinalis، (9/0%)L.agilis و (45/0%)L.acidipiscis،  می­شد و 1% از ایزوله‌ها نیز ناشناخته باقی ماند. نمونه‌هایی که به روش صنعتی خشک شده بودند حاوی لاکتیک اسید باکتری از جنس و گونه‌ی L.plantarum بود، اما نمونه‌ ترخینه‌ای که به روش سنتی خشک شده است، فاقد لاکتیک اسید باکتری بود.بحث و نتیجه­گیری: با توجه به محتوای بالای لاکتیک اسید باکتری­ها در محصول سنتی ترخینه­ی تر، تولید صنعتی و بهینه سازی روند تولید آن پیشنهاد می­گردد و می­توان مصرف این ماده­ی غذایی را به عنوان یک مکمل غذایی فراسودمند توصیه کرد.